叢枝菌根，也稱泡囊-叢枝菌根。國(guó)際上開(kāi)展對(duì)它的研究已有100多年的歷史，它是內(nèi)囊霉科的部分真菌與植物根形成共生體系，這種菌根在自然界普遍存在，已經(jīng)肯定了至少200個(gè)科20萬(wàn)種以上的植物都有叢枝菌根。農(nóng)作物種如小麥、玉米、棉花、煙草、大豆、菜豆、馬鈴薯、番茄、蘋果、葡萄、草莓、柑橘等都能形成叢枝菌根，最普遍的是豆科和禾本科植物；不能形成或很少形成叢枝菌根的只有十字花科、藜科、石竹科、莎草科、燈芯草科、蕁麻科等十多個(gè)科的植物。

叢枝菌根的主要特征是在植物根的皮層內(nèi)有叢枝和無(wú)隔菌絲，有的還能產(chǎn)生泡囊，這些結(jié)構(gòu)通過(guò)跟段染色后鏡檢可以觀察到，除形成上述結(jié)構(gòu)外，還可產(chǎn)生根外生菌絲，但比較松散，不像外生菌根那樣成菌套，外生菌絲的頂端常形成厚垣狍子。

叢枝菌根是植物和真菌的共生體。植物為菌根真菌的生命活動(dòng)提供碳源和能量，真菌的外生菌絲可以使叢枝菌根擴(kuò)增根圈的范圍，增加了根系對(duì)水分的吸收，提高植物的抗旱能力。同時(shí)，提高了從土壤中吸收磷素營(yíng)養(yǎng)的效率，為植物提供更多的磷素營(yíng)養(yǎng)，另外還可以吸收Z(yǔ)n、Cu、B、Mo、Fe、Mn等微量元素，并輸送給寄主植物，促進(jìn)了植物的生長(zhǎng)。叢枝菌根還可以促進(jìn)根圈范圍的其他細(xì)菌的生長(zhǎng)繁殖，并且菌根形成后某些氨基酸、菌類異黃酮、兒茶酚、還原糖和酶在植物體內(nèi)的含量增高，這些物質(zhì)具有抑制病原菌的作用，從而表現(xiàn)出防病效果，尤其對(duì)土傳病害效果更為明顯。