土壤中本來含有該種元素，由于種種原因植物不能吸收。
具體如下：
一、干旱
無(wú)水時(shí)元素不能成為溶解態(tài)或離子態(tài)，根無(wú)法吸收。所以缺素癥多出現(xiàn)在干旱年份或干旱季節(jié)。
二、土壤反應(yīng)(ph)不適
土壤反應(yīng)強(qiáng)烈影響營(yíng)養(yǎng)元素的溶解度，即有效性。有些元素在酸性條件下容易溶解，有效性高，有效性高，反應(yīng)趨向中性或堿性時(shí)溶解度--有效性降低。另外一些元素則與此相反，在堿性條件下有效性高而酸性條件下有效性低。與反應(yīng)關(guān)系特別密切的是微量元素。如鐵、硼、鋅、銅隨著pH下降(在pH4.5之前)溶解度顯著提高，有效性迅速增加，pH接近中性或趨向堿性時(shí)有效性下降，鉬則與此相反，其有效性隨pH提高而增加。大量元素對(duì)pH反應(yīng)一般比較遲鈍，但其中磷是例外，磷的適宜pH范圍極窄，嚴(yán)格說僅在pH6.5左右，<6.5和土壤中的鐵、鋁等結(jié)合而固定，pH值越低，鐵、鋁溶解度越大，固定量越多，>6.5則與土壤中的鈣結(jié)合固定，有效性也降低。不過，磷酸鈣的溶解度要比磷酸鐵、鋁大，所以偏堿性土壤的磷的有效性通常比酸性土來得高。
氮的最適pH值為6～8；磷的最適pH為6.5～7.5或8.5以上；鉀的最適pH為6～7.5；硫的最適pH值要在6以上向堿的方向；鈣的最適pH為6.5～8.5；鎂的最適pH為6.5～8.5；鐵的最適pH值要在6.5以下向酸的方向；硼的最適pH為5～7；錳的最適pH為5～6.5；鋅、銅的最適pH為5～7；鉬的最適pH值要在6以上向堿的方向。
三、吸附固定
即營(yíng)養(yǎng)元素被無(wú)機(jī)物或有機(jī)物所吸附固定，而不能為根系吸收。各元素的吸附固定與土壤或成土母質(zhì)有密切關(guān)系。
表16成土母質(zhì)和土壤對(duì)元素的吸附固定母質(zhì)、土壤 被固定的元素泥炭土、腐殖質(zhì)土 P K Ca B Mn Mo Zn Cu；堿土、蘇打土 Ca Mg Fe B Zn Cu；石灰性土壤 P Mn B Cu；有機(jī)質(zhì)多的土壤 Mn Zn Cu；花崗巖、片麻巖發(fā)育的土壤 Zn Mo；黃土母質(zhì)發(fā)育的土壤(蒙脫土的粘粒) B Ca Cu；水稻土 Zn；蛭石、智利石 K B；鐵結(jié)核的酸性土壤 Mo
四、元素間的不協(xié)調(diào)
1.氮：吸收硝態(tài)氮要比吸收氨態(tài)氮難;施用過量的鉀和磷都影響對(duì)氮的吸收;缺硼不利于氮的吸收。
2.磷：增加鋅可減少對(duì)磷的吸收;多氮不利于磷的吸收;鐵對(duì)磷的吸收也有拮抗作用;增施石灰可使磷成為不可給態(tài);鎂可促進(jìn)磷的吸收。
3.鉀：增加硼促進(jìn)對(duì)鉀的吸收，鋅可減少對(duì)鉀的吸收;多氮不利于鉀的吸收;鈣、鎂對(duì)鉀的吸收有拮抗作用。
4.鈣：鉀影響鈣的吸收，降低鈣營(yíng)養(yǎng)的水平;鎂影響鈣的運(yùn)輸，鎂和硼與鈣有拮抗作用;銨鹽能降低對(duì)鈣的吸收，減少鈣向果實(shí)的轉(zhuǎn)移;施入鈉、硫也可減少對(duì)鈣的吸收;增加土壤中的鋁、錳、氮，也會(huì)減少對(duì)鈣的吸收。
5.鎂：鉀多影響鎂的吸收，多量的鈉和磷不利于鎂的吸收，多氮可引起缺鎂。鎂和鈣、鉀、銨、氫有拮抗作用，增施硫酸鹽類可造成缺鎂。鎂能消除鈣的毒害。缺鎂易誘發(fā)缺鋅和缺錳。鎂和鋅有相互促進(jìn)的作用。
6.鐵：多硼影響鐵的吸收和降低植物體中鐵的含量，硝態(tài)氮影響鐵的吸收，釩和鐵有拮抗作用，引起缺鐵的元素比較多，它們的排列順序?yàn)镹i>Cu>Co>Gr>Zn>Mo>Mn，鉀不足可引起缺鐵;大量的氮、磷和鈣都可引起鐵的缺乏。
7.硼：鐵和鋁的氧化物可造成缺硼;鋁、鎂、鈣、鉀、鈉的氫氧化物可造成缺硼;長(zhǎng)期缺乏氮、磷、鉀和鐵會(huì)導(dǎo)致硼的缺乏;增加鉀可加重硼的缺乏，缺鉀會(huì)導(dǎo)致少量硼的中毒;氮量的增多，需硼量也增多，會(huì)導(dǎo)致硼的缺乏。錳對(duì)硼的吸收不利，植株需要適當(dāng)?shù)腃a/B和K/B比(如：葡萄健株的Ca/B為1234毫克當(dāng)量，K/B為1142毫克當(dāng)量)。以及適當(dāng)?shù)腃a/Mg比。硼對(duì)Ca/Mg和Ca/K比有控制作用。幾種能形成絡(luò)合物的元素，如鍶、鋁和鍺有臨時(shí)改善缺硼的作用。
8.錳：鈣、鋅、鐵阻礙對(duì)錳的吸收，鐵的氫氧化物可使錳呈沉淀狀態(tài)。施用生理堿性肥料使錳被固定。釩可減緩錳的毒害。硫和氯可增加釋放態(tài)和有效態(tài)的錳，有利于錳的吸收，銅不利于錳的吸收。
9.鉬：硝態(tài)氮有利于鉬的吸收，氨態(tài)氮不利于鉬的吸收;硫酸根不利于鉬的吸收。多量鈣、鋁、鉛以及鐵、銅、錳都阻礙對(duì)鉬的吸收。處于缺磷和缺硫的狀態(tài)，必然缺鉬，增加磷對(duì)鉬的吸收有利，增加硫則不利;磷多時(shí)需鉬也多，因此，磷過多有時(shí)會(huì)導(dǎo)致鉬的缺乏。
10.鋅：使鋅形成氫氧化物、碳酸鹽和磷酸鹽則成不可給態(tài).植物要求適當(dāng)?shù)腜/Zn比(一般為100～120，大于250則缺鋅)。磷過量會(huì)導(dǎo)致缺鋅，氮多時(shí)需鋅量也多，有時(shí)也會(huì)導(dǎo)致缺鋅，硝態(tài)氮有利于鋅的吸收，氯態(tài)氮不利于鋅的吸收。增多鉀和鈣不利鋅的吸收。錳、銅、相對(duì)鋅的吸收不利。鎂、鋅之間有互助吸收的作用。缺鋅會(huì)導(dǎo)致根系中少鉀。土中有Si/Mg比率低的粘粒會(huì)缺Zn，鋅拮抗鐵的吸收。
11.銅：施用生理酸性氯或鉀肥等可提高銅的活性，有利于吸收。生成銅的磷酸鹽、碳酸鹽和氫氧化物則有礙吸收，所以富含CO2、碳酸和含鈣多的土壤，不利于銅的吸收。多磷會(huì)導(dǎo)致缺銅。土壤嫌氣狀態(tài)產(chǎn)生H2S也有礙銅的吸收。銅還與鋁、鐵、鋅、錳元素拮抗。氮多時(shí)也不利于銅的吸收。
五、土壤理化性質(zhì)的不良
這里所說的理化性質(zhì)主要是指與養(yǎng)分吸收有關(guān)的因素。正常而旺盛的地上部的生長(zhǎng)有賴于根系的良好發(fā)育，根系分布越深越廣，吸收的養(yǎng)分?jǐn)?shù)量就越多，而且可能吸收到的養(yǎng)分種類也越多。土壤僵韌堅(jiān)實(shí)，底層有硬盤、漂白層、地下水位高等都會(huì)限制根系的伸展，減少作物對(duì)養(yǎng)分的吸收，加劇或引發(fā)缺素癥。高的地下水位如一些低地，在梅雨季節(jié)地下水位上升時(shí)期作物缺鉀癥較多發(fā)生，而在鈣質(zhì)土壤中，高的地下水位還使土壤溶液中重碳酸離子(H2CO3)增加而影響鐵的有效性，從而引發(fā)或加劇缺鐵癥等。不合理的土地平整使土性惡劣養(yǎng)分貧瘠的底土上升也常成為缺素的原因。
土壤陽(yáng)離子代換量(CEC)與缺素也有關(guān)，代換量小的砂土，因吸附保蓄養(yǎng)分容量小，對(duì)需要量較大的養(yǎng)分元素常不能滿足作物需要。有人研究指出CEC<5m·e/100g干土的大多數(shù)土壤無(wú)法保持足夠的K+以維持"高"的供鉀水平，也就是說是容易缺鉀的土壤。
