政府對農(nóng)業(yè)給予各種名目的高額補(bǔ)貼，每年用于農(nóng)業(yè)建設(shè)和價格補(bǔ)貼的各種資金高達(dá)4至5萬億日元，基本上相當(dāng)于農(nóng)業(yè)產(chǎn)值。
日本農(nóng)業(yè)是在政府極力保護(hù)下生存下來的。可以說，沒有政府極力呵護(hù)，也就沒有日本農(nóng)業(yè)。當(dāng)然，這一政策也飽受爭議。
日本農(nóng)業(yè)規(guī)模很小。2013年，日本廣義糧食自給率只有39%，農(nóng)業(yè)產(chǎn)值約為國內(nèi)生產(chǎn)總值的1%，除大米外幾乎所有農(nóng)產(chǎn)品需進(jìn)口才能滿足需求，是個典型的經(jīng)濟(jì)強(qiáng)國、農(nóng)業(yè)弱國。
日本共有耕地450萬公頃，其中40萬公頃被荒棄。農(nóng)業(yè)從業(yè)人員227萬，平均年齡66.5歲，每戶農(nóng)民平均擁有耕地2.45公頃，基本上屬于家庭式老人農(nóng)業(yè)，在國際上毫無競爭力。
為確保糧食安全和保護(hù)農(nóng)民利益，政府投入巨資對農(nóng)業(yè)進(jìn)行保護(hù)和扶持。日本對農(nóng)業(yè)的保護(hù)和扶持主要體現(xiàn)在稅制、補(bǔ)貼和控制農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)口等方面。首先，采取以工養(yǎng)農(nóng)政策，取消農(nóng)業(yè)稅賦。戰(zhàn)后，隨著經(jīng)濟(jì)高速發(fā)展，政府取消與農(nóng)業(yè)相關(guān)的大部分稅賦，并對從事農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的企業(yè)和個人在土地繼承、所得稅、贈與稅等方面給予優(yōu)惠。
其次，政府對農(nóng)業(yè)給予各種名目的高額補(bǔ)貼，每年用于農(nóng)業(yè)建設(shè)和價格補(bǔ)貼的各種資金高達(dá)4至5萬億日元，基本上相當(dāng)于農(nóng)業(yè)產(chǎn)值。根據(jù)《農(nóng)業(yè)基本法》，政府制定農(nóng)產(chǎn)品價格補(bǔ)貼政策，給許多農(nóng)產(chǎn)品提供價格補(bǔ)貼。由于大米在日本是唯一自給有余的農(nóng)產(chǎn)品，也是日本最重要的糧食作物，政府采用高價收購、低價銷售的政策進(jìn)行價格保護(hù)。在農(nóng)產(chǎn)品中，大米補(bǔ)貼最多。政府每年還要對大米收購和銷售價格進(jìn)行調(diào)整，保證大米價格漲幅高于其他農(nóng)產(chǎn)品。
在農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化設(shè)備補(bǔ)貼方面，規(guī)定農(nóng)民或團(tuán)體購買共同使用的機(jī)械設(shè)備由政府負(fù)擔(dān)30%至50%的費(fèi)用，以支持農(nóng)業(yè)機(jī)械化和現(xiàn)代化。
此外，日本采取高關(guān)稅和技術(shù)壁壘措施限制外國農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)口。日本還采用浮動關(guān)稅、差額關(guān)稅和特惠關(guān)稅等措施對農(nóng)產(chǎn)品進(jìn)口進(jìn)行調(diào)節(jié)。以大米為例，日本大米進(jìn)口量只占日本市場的約5%，進(jìn)口關(guān)稅一度高達(dá)490%，還有嚴(yán)格配額限制。日本市場上的大米均價為國際市場均價數(shù)倍，政府以競標(biāo)方式把進(jìn)口額度拍賣給進(jìn)口商，既控制總量又提高了價格。雖然日本產(chǎn)大米價格奇高，但因質(zhì)量高、口感好，所以一直長期占據(jù)著日本人的餐桌。
近年來，日本農(nóng)產(chǎn)品關(guān)稅有所下降，但非關(guān)稅壁壘日益突出，苛刻的技術(shù)指標(biāo)成為保護(hù)農(nóng)業(yè)的主要手段。例如，日本對農(nóng)產(chǎn)品農(nóng)藥和化肥殘留實(shí)施的標(biāo)準(zhǔn)，要比國際標(biāo)準(zhǔn)高出許多，讓很多外國農(nóng)產(chǎn)品難以進(jìn)入日本市場。
日本對農(nóng)業(yè)大力保護(hù)也引來質(zhì)疑聲。日本國內(nèi)有人認(rèn)為，正是政府的過度保護(hù)導(dǎo)致農(nóng)產(chǎn)品價格昂貴，損害了消費(fèi)者利益，還增加了財(cái)政負(fù)擔(dān)。國外批評人士認(rèn)為，日本的農(nóng)業(yè)政策屬于貿(mào)易保護(hù)主義，將不斷引發(fā)貿(mào)易摩擦。
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