一，叢枝菌根真菌可以制備新型的微生物肥料、生物調(diào)節(jié)劑和生物防治劑。它們的作用主要體現(xiàn)在：1，增加宿主植物對磷及其他營養(yǎng)元素如Ca、S、Zu、Cu等的吸收；2，提高宿主的抗逆性，如抗旱、抗寒、抗鹽堿等；3，提高宿主的抗病性，尤其對土傳病害效果更加顯著；4，促進土壤團粒結(jié)構(gòu)的形成起到改良土壤的作用。

二，表現(xiàn)在實際生產(chǎn)中能提高移栽苗成活率，縮短育苗期，提高磷肥利用率，減少磷化肥施用量，降低農(nóng)業(yè)成本投入，減輕化學肥料對環(huán)境造成的嚴重污染，促進水分傳導，抗旱節(jié)水，提高植物對土傳病害的抗性，減少根病，提前開花結(jié)果，使果實提早成熟，增加作物產(chǎn)量，改善品質(zhì)，增加鮮花產(chǎn)量及瓶插壽命。因此，這是一種和當前眾多的微生物肥料不同的新型微生物肥料。

三，叢枝菌根真菌還可以改善植物的氮素營養(yǎng)，叢枝菌根真菌植物根系的吸收面積增加，真菌絲可以吸收氮病轉(zhuǎn)移費植物，菌絲可以把吸附在黏土礦物上的不能移動的氨傳遞給植物的根系。用15N同位素蹤技術(shù)證實叢枝菌根真菌能直接吸收運轉(zhuǎn)氮，并且從枝菌根真菌與根瘤菌之間有互利作用，可以促進豆科植物結(jié)瘤和固氮作用，增加固氮菌的固氮速率從而獲得更多氮素，叢枝菌根真菌還可以通過菌絲橋?qū)⒋蠖构潭ㄔ诘D(zhuǎn)移給玉米，顯著增加玉米植株的生長和氮素營養(yǎng)的供應。