一，生物固氮作用

某些PGPR可將空氣中的分子態(tài)氮轉(zhuǎn)化為有機(jī)氮，供自身和作物利用，這在很大程度上改善了作物的氮素營(yíng)養(yǎng)，從而促進(jìn)了作物增產(chǎn)。

二，溶磷作用

在植物根圍普遍生存者能溶磷和解磷的細(xì)菌，這些細(xì)菌能夠通過(guò)釋放出有機(jī)酸如葡萄糖酸和2-酮葡萄糖酸來(lái)溶解無(wú)機(jī)磷，或分泌胞外磷酸酶降解有機(jī)磷，從而使磷被有效地吸收和利用。

三，產(chǎn)生鐵載體

鐵是植物的必須元素之一，某些PGPR可以通過(guò)生產(chǎn)和分泌各種具有高親和力的鐵載體，它能夠結(jié)合三價(jià)鐵并將其還原成為植物體能夠高效利用的二價(jià)鐵，PGPR產(chǎn)生的鐵載體可與植物根際病原微生物爭(zhēng)奪有限的鐵營(yíng)養(yǎng)，從而抑制了病原微生物的生長(zhǎng)繁殖，起到生物防治的作用；同時(shí)，微生物鐵載體可被生長(zhǎng)在鐵脅迫條件下的植物作為鐵源直接利用，因而在植物鐵營(yíng)養(yǎng)方面也起了重要的作用，且植物可利用微生物產(chǎn)生鐵載體螯合的鐵，從而改善了植物的鐵營(yíng)養(yǎng)，有效防治堿性缺鐵土壤植物缺鐵失綠癥的發(fā)生。

四，產(chǎn)生植物激素

許多PGPR可以產(chǎn)生植物生長(zhǎng)素、細(xì)胞分裂素和赤霉素等，促進(jìn)了植物根系的生長(zhǎng)發(fā)育以及有效吸收土壤中的水分和養(yǎng)分，同時(shí)，對(duì)植物的其他生命活動(dòng)進(jìn)行調(diào)控。

五，促進(jìn)其他有益微生物與宿主的共生

PGPR能夠刺激植物根部生長(zhǎng)，為根瘤菌的感染和結(jié)瘤提供了很多機(jī)會(huì)。生物肥料的PGPR在有些情況下可以通過(guò)刺激宿主植物和有益根際真菌的共生，如叢枝菌根（AM）可促進(jìn)植物的生長(zhǎng)。雖然AM本身就能促進(jìn)植物對(duì)各種土壤營(yíng)養(yǎng)成分的吸收（特別是土壤中的磷元素），但研究證明，接種某些PGPR能促進(jìn)植物與真菌之間的共生。