（一） 提供植物氮素

雖然大部分固定的氮為固氮菌自身利用，提供給植物的氮素很少，只有菌體裂解后的氮素才能被植物吸收，但由于細(xì)菌的生命周期比植物短得多，細(xì)菌死亡后釋放的有機(jī)氮能逐步為植物吸收。自然界氮?dú)夤潭ㄓ袃煞N方式：一種是非生物固氮，即通過(guò)閃電，高溫放電等固氮，這樣形成的氮化物很少；二是生物固氮，即分子態(tài)氮在生物體內(nèi)還原為銨的過(guò)程。大氣中90%以上的分子態(tài)氮都是通過(guò)固氮微生物的作用被還原為氨的。如果把光合作用看做是地球上最重要的生物化學(xué)反應(yīng)的話(huà)，則生物固氮應(yīng)當(dāng)是地球上僅次于光合作用的第二個(gè)最重要的生物化學(xué)反應(yīng)。生物固氮是一種極其溫和的生物化學(xué)反應(yīng)，它比人類(lèi)發(fā)明的利用鐵催化劑，在高溫，高壓下的化學(xué)固氮要優(yōu)越得多。

（二） 產(chǎn)生植物激素

目前，分離出的聯(lián)合固氮菌很多具有產(chǎn)生植物激素的功能。如IAA，ABA等影響根的呼吸速率和代謝，刺激根毛和次生根的形成，促進(jìn)宿主植物對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收。

（三） 微生物調(diào)節(jié)

當(dāng)聯(lián)合固氮菌在根際微域或植物體內(nèi)部形成優(yōu)勢(shì)菌群后，可以起到調(diào)節(jié)根際生態(tài)平衡，阻止有害菌的入侵和定植，起到生物屏蔽的保護(hù)作用。

（四） 分泌有機(jī)酸

固氮菌可以分泌有機(jī)酸使得植物根際PH值下降，使難溶性礦物質(zhì)變的易溶，從而促進(jìn)植物根系對(duì)各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收，進(jìn)而間接的促進(jìn)植物生長(zhǎng)。