生物肥料的種類不同，用法也不同。單純生物肥料用量少，一般地每畝用量0.5-2公斤，作拌種、沾秧根或葉面噴施用。如大豆根瘤菌肥，可采用泥漿法對種子進行接種，將一份菌劑加入0.5-1份米湯調(diào)制成漿糊狀拌在大豆種子上。生物有機無機復合肥，一般地每畝用量30-75公斤作基肥或種肥進行機械播種。生物有機肥 一般地用量較大，每畝施50-80公斤，作基肥應用。生物有機肥在旱田作基肥時，結(jié)合秋、春整地一次性施入。水稻田作基肥，在水耙前一次施入。
在生產(chǎn)、運輸、使用生物肥料時，應注意以下五點：①加工生產(chǎn)肥料，烘干溫度不應超過80度，否則影響活菌數(shù)；②在儲存、運輸生物肥料，應避免受潮或雨淋；③用生物肥料拌種風干時，要避免陽光直射；④使用生物肥必須考慮土壤的物理因素、化學因素和生物因素；⑤生物肥不能與種衣劑等農(nóng)藥、生理酸性肥料同時使用。
