微量元素肥料的施用方法很多，有土壤施肥、種子處理和根外追肥等。
土壤施肥 即做基肥、種肥或追肥時(shí)把微量元素肥料施入土壤。這種施法雖然肥料的利用率較低，但有一定的后效。含微量元素的工業(yè)廢棄物和緩效性微肥常采用這種施肥方法。
種子處理 包括浸種和拌種兩種方法。浸種時(shí)將種子浸入微量元素溶液中，種子吸收溶液而膨脹，肥料隨水進(jìn)入。常用的濃度是0.01%-0.1%，時(shí)間是12-24小時(shí)。拌種是用少量水將微量元素肥料溶解，將溶液噴灑于種子上，攪拌均勻，使種子外面沾上溶液后陰干播種，一般每千克種子用2-6克肥料。
根外追肥 即將微量元素肥料溶液用噴霧器噴施到植株上，通過葉面或氣孔吸收而運(yùn)轉(zhuǎn)到植株體內(nèi)。常用的溶液濃度是0.01%-0.1%。
蘸秧根 這是水稻的特殊施肥法，其它需要移栽的農(nóng)作物也可以采用蘸秧根的方法施肥。
