芹菜適宜多施氮肥，但不宜追施尿素。芹菜在整個生長期間需要大量氮素肥料，追肥要以碳酸氫銨為主。做到少量多次，一般需追肥2-3次。但要注意，芹菜不宜追施尿素，因為芹菜追施尿素后生長反而緩慢，纖維素增多，植株容易老化，品質(zhì)降低，食用時帶有苦味。
追施有機肥，可提高芹菜品質(zhì)。追施漚制腐熟的雞鴨等家禽有機肥，芹菜植株柔嫩粗壯，纖維減少，品質(zhì)和產(chǎn)量大大提高。但沒有腐熟的農(nóng)家有機肥不可作追肥施用，以免引起燒蔸爛根。
補施微肥，可防芹菜生理病害。缺鈣會引起芹菜“燒心”，缺硼則會引起芹菜空心、葉柄開裂等生理病害。葉面噴施0.5%氯化鈣或硝酸鈣水溶液，可防止芹菜“燒心”。為防止芹菜空心、葉柄開裂，可每畝基施硼砂0.5-0.75公斤，或用0.3%-0.5%硼砂溶液葉面噴施。
