磷對大豆根系生長有促進作用，也有利于根瘤的形成。當土壤中磷的供應不足時，大豆根瘤雖然能侵入根中，但是不結瘤。鉬肥是根瘤固氮必不可少的微量元素，在土壤缺磷的情況下，單施鉬肥反而使根瘤減少。磷對根瘤中氨基酸的合成以及根瘤中可溶性氮向植株其他部分轉移，都起著重要作用。所以種植大豆或其他豆科作物，施用磷肥增產效果特別顯著。
磷肥在土壤中移動性小，容易被吸附固定，因此磷肥應該與有機肥混合堆漚后，采用溝施、穴施等集中施用方法為好。每畝施用量過磷酸鈣為15~25公斤，缺磷嚴重的土壤，用量可適當增加。大豆播種時間可用少量過磷酸鈣拌種，以滿足苗期生長和根瘤菌繁殖對磷的需要。大豆可用磷酸二氫鉀進行葉面施肥，濃度為0.1%~0.2%，在初花期和終花期各噴一次，每次用100克左右，也有一定增產效果。
