1、在有效期內(nèi)選用質量有保證的產(chǎn)品。微生物肥料種類繁多，可分成根瘤菌肥料、固氮菌肥料、磷細菌肥料、鉀細菌肥料、復合微生物肥料等五類。在選用這些肥料時，一是要注意產(chǎn)品是否有嚴格的檢測登記程序，是否有農(nóng)業(yè)部頒發(fā)的生產(chǎn)許可證。二是最好選用當年生產(chǎn)的產(chǎn)品。產(chǎn)品中有效微生物數(shù)量是隨保存時間、保存條件的變化逐步減少的。若數(shù)量過少，則會失效。特別是霉變或超過保存期的產(chǎn)品更不能選用。

　　2、妥善貯存。微生物肥料要避免陽光直曬，防止紫外線殺死肥料中的微生物。微生物肥料貯存的環(huán)境溫度以15-28℃為最佳。

　　3、巧妙搭配有機肥等肥料。微生物肥料與有機肥混合漚制（嚴格控制高溫），能起到增效作用。配合使用復合肥、葉面肥、CO2氣肥，這樣能更有效控制硝酸鹽、亞硝酸鹽含量。

　　4、配合使用農(nóng)業(yè)技術措施。改善土壤環(huán)境條件對微生物的活動和繁殖有著重要的作用。因此，土壤要采取深耕翻措施，搞好中耕，作好排澇防旱工作。還要抓好秸稈還田，增施有機肥等措施，始終保持耕作層的碳源充足和疏松、濕潤環(huán)境，從而發(fā)揮微生物肥增產(chǎn)增效的肥力作用。