化肥污染指的是農(nóng)田施用大量化肥后引發(fā)的一些對土壤的危害與污染，例如改變當(dāng)?shù)赝寥赖乃釅A度。農(nóng)田不管是使用哪種品牌的的化肥，都不可能全部被植物吸收利用，都會有殘余滲透進(jìn)土壤下層或是根系下層而造成。可導(dǎo)致當(dāng)?shù)丨h(huán)境的破壞以及土壤河流的富營養(yǎng)化。食品、飼料以及飲用水中有毒成分也會增加。為防止污染環(huán)境，應(yīng)對使用的化學(xué)肥料進(jìn)行控制和管理，對土壤對化肥的使用量也需要嚴(yán)加控制。

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?現(xiàn)代農(nóng)業(yè)已經(jīng)偏向工業(yè)化，很多農(nóng)戶過于依賴使用化肥后農(nóng)產(chǎn)品的高產(chǎn)，甚至過量使用化肥，使得農(nóng)業(yè)系統(tǒng)內(nèi)部結(jié)構(gòu)遭到破壞，土壤基質(zhì)含量下降，反而讓土壤中的氮、磷、鉀元素降低。亦或是造成土壤結(jié)晶化，使得農(nóng)肥隨著地表徑流和農(nóng)田排水而流失。因此在農(nóng)作業(yè)的同時(shí)，對化肥的使用要嚴(yán)格控制使用量與濃度。

長期使用化學(xué)肥料對土壤酸度有較大影響。過磷酸鈣、硫酸銨、氯化銨、氯化鉀等屬于生理酸性肥料,即植物吸收肥料中養(yǎng)分離子后土壤中H+增多。

酸性土壤上一個嚴(yán)重的問題是養(yǎng)分有效性低，而且所涉及的養(yǎng)分種類也比較多。例如酸性土壤普遍缺氮、磷和鉀;很多土壤缺鈣和鎂;有些土壤缺鉬。這些養(yǎng)分的缺乏主要是由酸性土壤組成的特性及氣候特點(diǎn)所決定的。酸性土壤中鐵、鋁活性高，與磷形成難溶性的鐵磷和鋁磷，甚至有效性更低的閉蓄態(tài)磷，使土壤磷和施入土壤中的肥料磷絕大部分轉(zhuǎn)化為固定態(tài)磷，致使絕大多數(shù)的酸性土壤都嚴(yán)重缺磷。