一、土壤有害微生物的積累

因?yàn)樵O(shè)施土壤一年四季均具有病原菌生長繁殖的適宜溫度，使得土壤中病原菌數(shù)量不斷增加，同時(shí)設(shè)施栽培中化肥的過多使用也導(dǎo)致土壤中病原拮抗菌的減少，更加助長了病原菌的繁殖。

二、土壤理化性狀變劣

連作土壤種植作物種類單一，而作物對(duì)營養(yǎng)和肥料的吸收具有選擇性，因此多年連作以后勢必造成土壤中養(yǎng)分的比例失調(diào)，尤其是一些微量元素缺乏。設(shè)施栽培中普遍存在超量施肥和不平衡施肥現(xiàn)象，也容易造成土壤養(yǎng)分失衡，破壞土壤的物理結(jié)構(gòu)，帶來酸化、板結(jié)、次生鹽漬化等一系列問題。

三、蔬菜的自毒作用

一些植物可通過地上部淋溶、根系分泌物和植物殘茬腐解等途徑來釋放一些物質(zhì)對(duì)同茬或下茬同種或同科植物生長產(chǎn)生抑制作用。