一、耕作層變淺
在長期不深耕、不深松，機(jī)械耕作碾壓踐踏的情形下，許多耕地的土壤耕作層由過去20-30公分減至15公分以下。
加之降雨、灌水沉實(shí)，“犁底層”位置上移并加厚，成為堅(jiān)硬深厚的阻隔層，阻礙了土壤水分、養(yǎng)分和空氣的上下運(yùn)行，作物根系下扎延伸受阻，土壤蓄水減少、抗旱性能下降，土壤養(yǎng)分有效性減少、作物營養(yǎng)狀況惡化。
二、土壤有機(jī)質(zhì)減少
一是長期不施或少施農(nóng)家肥，缺少秸稈還田，不種植綠肥，土壤有機(jī)質(zhì)得不到補(bǔ)充;二是超量施用化學(xué)氮肥，以及超出土壤負(fù)荷的高產(chǎn);頻繁的表土耕翻，加劇土壤碳的耗竭，致使土壤有機(jī)質(zhì)含量減少。
土壤有機(jī)質(zhì)的減少會引發(fā)土壤結(jié)構(gòu)破壞和土壤板結(jié)，使土壤肥力下降，生物性質(zhì)惡化，土壤酸化和次生鹽堿化，土傳病害加劇，土壤凈化能力減退等。
三、土壤板結(jié)
由于耕地土壤有機(jī)質(zhì)缺乏，加上不合理的耕作和灌溉，大量施用化肥，導(dǎo)致土壤酸化，土壤次生鹽堿化，破壞了土壤團(tuán)粒結(jié)，致使土壤板結(jié)。
土壤板結(jié)直接導(dǎo)致土壤和植物系統(tǒng)缺氧、缺水、缺肥，影響土壤和植物系統(tǒng)的物質(zhì)轉(zhuǎn)化和能量交換。
四、土壤酸化
長期過量使用生理酸性肥料和化學(xué)氮肥，土壤中的酸性物質(zhì)不斷積累，土壤中的鈣鎂等堿性物質(zhì)缺乏必要的調(diào)節(jié)和補(bǔ)充，使土壤出現(xiàn)酸化現(xiàn)象。
土壤酸化會加速土壤貧瘠化，土壤有害重金屬活化，土壤有害微生物增加，最終導(dǎo)致土傳病害發(fā)生。
五、土壤次生鹽堿化
由于長期過量使用化學(xué)肥料，使土壤中的鹽分不斷積累，尤其硝酸鹽。這些鹽分隨土壤水分上行聚集到地表，形成土壤表層次生鹽堿化，土壤結(jié)構(gòu)遭破壞，理化生物性質(zhì)惡化。
輕則影響種子發(fā)芽出苗，阻礙養(yǎng)分吸收，作物生長不良;重則造成作物生理干旱，營養(yǎng)障礙、鹽害甚至死亡。
六、土壤營養(yǎng)失調(diào)
生產(chǎn)中不按作物所需營養(yǎng)元素比例施肥，不作測土配方施肥，盲目過量施用氮磷鉀，不施或少施有機(jī)肥和中微量元素肥，造成土壤中氮、磷富集，鉀、硅、鈣、鎂、硼、鋅、鐵、鉬等中微量元素耗竭。
氮磷鉀比例失調(diào)，中微量元素間營養(yǎng)比例失調(diào)，導(dǎo)致土壤營養(yǎng)元素拮抗，有肥而無用。
七、土壤污染
農(nóng)業(yè)系統(tǒng)外的“三廢”污染，過量化肥、農(nóng)藥、農(nóng)膜殘留污染，未經(jīng)處理的有機(jī)肥污染，以及有害病原物等污染時常會進(jìn)入耕地土壤。
當(dāng)這些污染物殘留的累積超出土壤自凈化能力后就會“溢出”，造成耕地土壤的重金屬、有機(jī)污染物和致病生物超標(biāo)。
耕地土壤被污染后，會破壞土壤生態(tài)平衡，使土壤有益生物大量死亡，土壤生物種群減少，土壤理化生物性質(zhì)惡化，土壤活性下降。
八、土壤侵蝕
耕地土壤侵蝕主要表現(xiàn)有水蝕、風(fēng)蝕和耕蝕。
坡地土壤墾殖過度，使水土流失;墾后缺乏坡改梯、水平溝耕作、植物籬等保護(hù)性耕作措施;隨意挖地耕翻，造成耕蝕，加劇了風(fēng)蝕、水蝕。
長期水土的流失導(dǎo)致土壤沙化，土層變薄，養(yǎng)分流失，保水保肥能力降低。
九、土壤、植物系統(tǒng)病
由于連續(xù)在同一塊耕地上種植同一種或同科作物，作物根系分泌物、殘留物和某些病原生物在土壤中大量積累，致使土壤營養(yǎng)失衡。
土壤微生物生態(tài)群落被破壞，土壤對“有害微生物”的凈化能力或抑制作用下降。
土壤、植物系統(tǒng)病的根源在土壤，表現(xiàn)在作物，當(dāng)有病的土壤遇到免疫力差的植物，即會以植物病的形式表現(xiàn)出來，生產(chǎn)上常稱作重茬病、連作障礙、再植障礙。
十、設(shè)施農(nóng)業(yè)土壤綜合癥
在高度集約化、高復(fù)種指數(shù)、高強(qiáng)度利用、高頻度人為干擾，過量施肥，過量用藥，過量灌水，過度耕作與踐踏等強(qiáng)烈干擾和巨大壓力下，設(shè)施土壤健康急劇惡化。
許多耕地種植2-3年，就出現(xiàn)土壤結(jié)構(gòu)破壞，土壤營養(yǎng)失衡，土壤酸化，土壤次生鹽堿化，土壤有害物質(zhì)積累，土壤微生物種群多樣性和功能退化等一系列土壤病。
