一、造成作物缺素

酸化的土壤中氫離子超標，它會直接危害作物根系造成根系卷曲、變脆、變硬，吸收功能受阻。作物缺乏營養(yǎng)嚴重時可造成死棵爛根。酸化土壤中的錳離子和鋁離子將磷元素固定，無法被作物吸收，大量錳離子、鋁離子進入作物體內(nèi)，排斥其他離子元素的吸收，造成作物缺鐵、缺鈣、缺鎂及多種營養(yǎng)元素的吸收造成果實產(chǎn)量下降著色不良等，如辣椒的黑皮病。

二、增加作物病蟲害

地下害蟲(如竹煌、線蟲等)生存環(huán)境與土壤pH值密切相關(guān)。線蟲的暴發(fā)流行和土壤的酸化有著直接關(guān)系，經(jīng)大量調(diào)查，pH值越低線蟲的危害越嚴重，這跟線蟲喜歡酸性環(huán)境有很大關(guān)系。

三、影響了土壤微生物的生存繁殖

土壤微生物一般最適宜pH值為6.5～7.5的中性范圍，過酸或過堿都會嚴重抑制土壤微生物的生存空間，有害微生物種群數(shù)量就會增多，有益微生物種群數(shù)量會大幅減少，從而影響氮素及其他養(yǎng)分的轉(zhuǎn)化和供應(yīng)，并增加作物根部病害的發(fā)病率。